本项目研究明确了我国可可资源农艺性状和可可脂含量变异情况，筛选出籽粒数多、粒重大、可可脂含量高等优异资源11份；从可可基因组中分别克隆出TcSUT、TcSUS和TcSPS基因家族成员的基因序列，明确了3个基因家族成员的基因结构和进化关系，弄清了3个基因家族成员的表达模式，揭示了可可产量形成过程中光合产物的转运与分配机制；结合可可果实性状表型与SSR标记多样性，获得与果实形态性状显著关联的18个位点，对形态变异贡献率为5.5%～13.1%，发表论文4篇。项目研究成果为可可优异等位基因发掘、分子标记辅助育种以及高产优质品种选育提供了理论依据和技术支撑。