本研究针对木薯遗传改良中存在的基因组高杂合度及选择效率低的问题，在已有木薯基因组测序与注释基础上，采用我国木薯种质库中158份原始种质及巴西国家农牧研究院200份核心种质，同步开展了重要经济农艺性状的鉴定，同时完成全部种质的基因型分析，构建高密度单倍型图谱，解析群体遗传结构并获得重要性状的关联标记。通过GWAS分析，最终获得13个农艺、产量性状的43个关联标记。标记的贡献率在14.5-36.8%。鉴定出62个关联基因，特别是发现与块根产量及块根干物质率同时关联的一个基因AtSweet1与蔗糖跨膜运输密切相关。完成耐旱性，耐寒性的全基因组标记，获得相关候选基因。发表具有领域影响力的学术论文6篇，正在审稿论文2篇。获得2016-2017神农中华农业科技二等奖1项。