果皮色泽是芒果果实外观的重要性状之一，外观艳丽的红芒品种更受消费者的青睐，探明芒果果皮色泽的遗传规律，培育果实品质优良且具红色果皮的品种有重要意义。利用分子标记辅助选择技术，进行早期选择可以缩短育种年限。基于芒果转录组54,207条unigene查找到4,103个SSR位点，三核苷酸重复为主导重复类型，占SSR总数的38.19%。根据SSR侧翼序列共设计6915对SSR引物，随机挑选了230对进行PCR检测，获得93对多态性引物。优化并建立了芒果TRAP标记体系，获得具良好多态性的引物组合66个。以金煌、爱文以及其杂交F1代173个实生单株为材料进行简化基因组测序，共得到318,414个SLAF标签，经过一系列筛选，进行连锁群分析后得到上图标记6,594个，采用HighMap软件最终得到总图距为3,148.28 cM的遗传图谱。