应用多位点序列分型（MLST）技术对海南省2005-2015年从流行性脑脊髓膜炎（流脑）病人，密切接触者和健康者中分离到的脑膜炎奈瑟菌17份进行核酸序列分析，结果17份样共有11种不同序列型（ST），分属于ST-4821、ST-11、ST-5、ST-175、ST-364克隆群和5个无序列群分类（UA），其中ST-4821克隆群有ST-4821型和ST-3200型，病人C群3株和密接者不可分群1株均是ST-4821型。ST-3200型来自C群健康者，病人B群1株为UA。揭示海南菌株分子型别具有基因多样性，C群菌ST-4821型是优势流行菌群序列型。健康人群携带有高致病性ST-4821、ST-11、ST-5克隆群菌株。采用纸片扩法结合E-test试纸条法对菌株进行14种抗生素敏感性试验，结果实验菌株对氨苄西林、头孢噻肟、头孢曲松、美罗培南、氯霉素、阿奇霉素、利福平、米诺环素100%敏感，对青霉素91.7%敏感，对复方新诺明、磺胺83.3%耐药，为流脑病人治疗和带菌者预防指导用药提供科学依据。