项目对海南省栽培的麒麟菜和3个自然保护区的麒麟菜种质资源进行了调查分析，应用ISSR分子标记技术初步构建了海南麒麟菜种质资源分子标记数据库，进行种质创新利用和人工繁殖技术研究，并选育出两株优良品系：一是产胶率高的异枝麒麟菜株系（编号ZＣ3），另一个是温度适应范围较广的琼枝麒麟菜株系（编号ZL6）。初步建立了麒麟菜种质检测评价技术体系，评价参数包括藻体形态特征、表皮细胞光学特征、四分孢子特征、叶绿素含量、生长速率、温度适应范围、产胶率等，麒麟菜亲本最适生长温度为25℃～30℃，在海水比重为1.020-1.025，营养盐丰富、水流较快的海区生长较快，施用碳酸氢铵促生长效果好。