一种雨生红球藻来源的虾青素晶体及其制备工艺，涉及虾青素提取工艺领域，雨生红球藻来源的虾青素晶体的制备工艺是将由雨生红球藻提取得到的虾青素油脂，与碱性离子液体乙醇溶液混合搅拌进行酯交换，得酯交换产物；将酯交换产物降温结晶，过滤得到的滤饼即为虾青素粗品，再用乙酸乙酯进行重结晶得到暗红色的虾青素晶体。该制备工艺是利用碱性离子液体催化虾青素酯进行酯交换，制得的雨生红球藻来源的虾青素晶体其中的虾青素纯度高。