本发明公开了一种基于智能马桶的健康监测系统，通过对用户的尿液提取采样，再利用传感器对尿液样本进行多种指标的尿液检测分析，得出用户的生理指标并返回给用户终端，用户再根据尿液检测结果、进餐时间等信息，到远程医疗健康云服务器上进行查询或咨询，其查询或咨询的结果又能方便快捷地返回给用户。本发明在具体的配置中不需要更多的辅助设备，样本的取样、检测等都设计在马桶内部，且取样、检测的精度十分准确，还能大大节约空间和成本，适合普通家庭使用。