本发明公开一种基于遗传编程的多元回归预测模型优化方法，通过初始多元回归预测模型簇构造和多元回归预测模型簇进化两个模块来获取最优的多元回归预测模型。初始多元回归预测模型簇构造模块生成用户指定数量的多元回归预测模型个体，并优化每个模型个体的权重参数。多元回归预测模型簇进化模块对初始多元回归预测模型簇进行解析之后，基于遗传编程策略实现选择、解析、交叉、变异和评估五个操作的迭代处理，并将最终的最优多元回归预测模型个体返回给用户。与现有技术相比，本发明具有准确度高、速度快以及泛化能力强等优点，能够有效应用于智能交通、电子商务、生物信息、医疗健康和社会公共安全等领域。