本发明属于造血干细胞移植分析技术领域，公开了一种鉴定造血干细胞移植术效果的信息分析系统及分析方法，所述鉴定造血干细胞移植术效果的信息分析系统包括：增强移入模块、计数模块、生理参数检测模块、中央控制模块、分析评估模块、信息加密模块、数据存储模块、显示模块。本发明通过增强移入模块加快的移入缩短受试者易感潜在的致命性感染、出血和其他严重并发症的时间段。同时，通过信息加密模块够不利用现有的RSA、随机种子等方式完成对数据的加密，因此对包括个人隐私在内的医疗健康信息实现了强度较高的加密。