本发明公开了一种由甘油制备1，3-二羟基丙酮的新方法，所述制备方法包括如下步骤：(1)缩醛化反应：在带水剂存在下，甘油和苯甲醛在酸催化剂A作用下发生缩醛化反应得到结构如式(I)所示的甘油苯甲醛缩醛醚；(2)氧化反应：所得的甘油苯甲醛缩醛醚在有机溶剂中在氧化剂作用下被氧化得到结构如式(II)所示的5-羰基-2-苯基-1，3-二氧杂环己烷；(3)水解反应：所得5-羰基-2-苯基-1，3-二氧杂环己烷在酸催化剂B存在下水解制得结构如式(III)所示的1，3-二羟基丙酮二聚体。本发明的合成路线以甘油为原料，选择性与收率均比直接氧化的方法高，目标产物分离简便，产品纯度可达99％，相比于现有技术，本发明所述合成路线具有较大的市场竞争力。