本发明涉及一种采用分子蒸馏技术提纯山苍子芳香油的方法，是将山苍子芳香油脱除水分处理后进行分子蒸馏分离，分离山苍子油中的低沸点成份，将重组份收集再进行二次分子蒸馏分离，收集高沸点成份获得柠檬醛产品。本发明工艺简单，采用分子蒸馏分离技术，对山苍子芳香油分离获取高纯度的柠檬醛产品，解决了山苍子芳香油分离过程中产率低、品质下降与结焦的问题，物料加热温度低，能耗低，停留时间短，蒸发强度高，效率高，最大限度地保持了原料的天然性，对环境无污染。