本发明公开了一种具有清除自由基功能的海南青梅茎提取物及其制备方法，是在海南青梅茎的干燥粉末中加入有机溶剂提取；提取液经过滤、减压浓缩得到总浸膏，加水混悬，依次用石油醚、乙酸乙酯萃取，减压回收分别得到石油醚部分、乙酸乙酯部分，所得乙酸乙酯部分经氯仿与甲醇混合溶剂系统梯度洗脱，其中体积比为100 : 30的氯仿与甲醇洗脱组分具有优良的清除自由基活性，该组分包括16个白藜芦醇低聚体类化合物。本发明制得的提取物得率高，工艺流程简单，成本低廉，适合较大规模的制备，所得提取物具有优良清除自由基活性，可应用于抗氧化与清除自由基功能的保健食品、药品和食品中。