本发明提供了一种治疗溃疡性结肠炎的药物组合物及其制备方法和应用，所述的药物组合物组成成分及其含量按重量份计包括：谷氨酸5～35份、腺苷1～10份、多巴胺1～10份、精氨酸5～35份、谷氨酰胺5～25份、苏氨酸5～25份、甲硫氨酸1～10份、丝氨酸1～10份、脯氨酸5～25份、环甘?脯二肽5～25份。所述的药物组合物可以是任何适合服用的药物剂型，优选液体制剂。本发明所述的药物组合物对溃疡性结肠炎的治疗总有效率可以达到94%，且痊愈后复发几率小。