本发明提供了一种治疗消化性溃疡的药物组合物及其制备方法和应用，所述的药物组合物组成成分及其含量按重量份计包括：腺苷1～10份、精氨酸10～35份、多巴胺1～10份、色氨酸1～10份、谷氨酰胺6～25份、苏氨酸8～35份、甲硫氨酸6～25份、丝氨酸6～25份、脯氨酸8～35份、环(甘-脯)二肽1～10份。所述的药物组合物可以是任何适合服用的药物剂型，优选液体制剂、片剂、胶囊剂。本发明所述的药物组合物对大鼠胃溃疡模型的溃疡抑制率能达到71％，对消化性溃疡治疗总有效率能达到96％，且痊愈后复发几率小。