本发明公开了一种诺丽果酵素的加工方法，包括以下步骤：(1)选料处理(2)酶解(3)第一次发酵(4)第二次发酵(5)第三次发酵(6)冷滤(7)调配。该方法选用共生菌株进行三次发酵，较大程度的保留了诺丽果中的有效成分，保证了产品的质量，提高了诺丽酵素的活性，对人体起到保健的效果。