本发明涉及一种便于扫描电镜观察的简易硅藻净化处理方法。该方法采用酒精梯度脱水后置于铝箔纸直接烘干的方法实现硅藻壳体的净化，操作简单、效率高、安全性高、耗时少、不对环境造成污染，能使硅藻壳体保有原有种属硅藻的形貌和微观结构并且易于观察。本发明的有益效果是：该方法通过采用梯度酒精高速离心去除硅藻壳周围的杂质组分，净化效果好，且不易破坏原有种属硅藻的形貌。在较短时间烘干后的硅藻有效地吸附在铝箔纸上；操作简单、耗时少、效率高、安全性高、不对环境造成污染，能使硅藻壳体保有原有种属硅藻的形貌和微观结构的特点。