本发明公开了一株防治香蕉枯萎病的细菌及其应用。本发明所提供的细菌具体为芽孢杆菌(Bacillus?sp.)Bsp.6，它在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心的保藏编号为CGMCC?No.6459。实验证明，本发明所提供的芽孢杆菌(Bacillus?sp.)Bsp.6CGMCC?No.6459能够同时抑制古巴尖镰孢菌(Fusantan?oxysporumf．sp．cubense)1号和4号小种。以所述芽孢杆菌(Bacillus?sp.)Bsp.6CGMCC?No.6459为活性成分的菌剂能够防控粉蕉枯萎病，其大田防控效果达95%左右；本发明所提供的芽孢杆菌(Bacillus?sp.)Bsp.6CGMCC?No.6459及其菌剂对于粉蕉枯萎病具有显著的防控效果，这将很大程度上促进香蕉种植业的快速发展。