本发明公开了一种天然胶乳资源分层次全利用的环保型加工方法，包括：割胶时加入化学肥料尿素作为新鲜胶乳的保存剂、防腐剂和脱蛋白剂；加工时加入由表面活性剂、氧化交联剂或功能增强剂构成的组合稳定剂；通过一次离心将胶乳分离为低蛋白浓缩胶乳和胶清分离液后，再按产品或用途进一步加工成低蛋白天然橡胶产品、或具有不同使用功能的液体生物制剂或微生物菌剂活化剂；胶清分离液部分返回加工过程重复利用；生产低蛋白固体天然橡胶产品过程产生的凝胶、压榨、漂洗废水净化处理后作为洗涤水回用于生产过程循环利用不外排；天然胶乳资源分层次全利用的清洁生产方法，大幅度削减了污染负荷，降低了生产成本和环境污染控制成本，提高了企业经济效益。