本发明公开了一种批量冷冻石斑鱼精子的方法，包括精子采集、精子与抗冻保护液混合、分装与冷冻等步骤。本发明方法针对小量冻存精子费时费力，不能满足实际生产需要的问题，采用液氮样品架批量快速冻存石斑鱼精子。通过本方法，可以快速冻存石斑鱼精子数百毫升，解冻后平均活力大于90％，解决人工繁殖石斑鱼需要大量精子的问题。