本发明的热区微藻培养系统，包括透明容器以及光源，透明容器悬挂于横杆上，接头模块包括盖体，盖体的内部设置有第一通槽以及与第一通槽平行的第二通槽，第二通槽、第一通槽内分别设置有伸入透明容器的内部的通气管以及取样管，通气管的位于透明容器的外部的一端与通气泵的输出端连接，取样管的位于透明容器的外部的一端与取样泵的输出端连接，通气泵与取样泵均设置于盖体上。本发明的热区微藻培养系统具有更不易污染、密度更高、成本更低的优点。本发明的热区微藻培养系统的透明容器、光源、横杆、接头模块组成了一种低成本、操作便利、可有效避免污染的微藻吊袋培养装置。