本发明提供的表情图像标注的方法和系统，可实现诱导视频和实验过程中采集的拍摄视频同步操作，两视频同步操作，诱导视频可帮助被试回忆在实验过程中观看该诱导视频时的情感变化。在诱导视频引起被试情感变化的时刻对拍摄视频实施暂停播放操作，接着从拍摄视频中截取被试头肩部位图像，并对截取图像进行表情类别和表情强度的标注。该方法和系统通过对拍摄视频和诱导视频的同步操作来帮助被试对观看视频时出现的表情进行表情标注，从而保证了标注数据的客观性与准确性。标注的过程中产生标注数据自动存储到数据库中，免去实验结束后工作人员繁琐复杂的工作，实现了以简单便捷的方法获取客观精确的表情图像及其标注信息。