本发明属于水产动物细菌性疾病防控领域，涉及一种黄芩苷在制备水产动物链球菌病防治药物中的用途，公开了黄芩苷在抑制罗非鱼源无乳链球菌β‑溶血/溶细胞素的活性，并将其应用于制备防治水产养殖动物细菌性疾病药物，尤其是罗非鱼无乳链球菌病的防控药物，具有显著的疗效，黄芩苷是从双子叶唇形科植物黄芩的干燥根中提取分离出来的一种黄酮类活性成分，作为罗非鱼源链球菌防治新药进行开发，具有来源丰富、成本低、耐药机率低、残留风险低、毒副作用小、环境友好、无污染、无公害和疗效显著等优势，具有广阔的应用前景。