本发明提供了一种检测水产养殖过程中污水排放内抗生素药类含量的系统，包括：检测箱，其通过立架立于待测品旁，检测箱内设置有第一空腔；反应室，其安装在第一空腔底壁上，在反应室底部连通有伸出检测箱外的排液管，排液管内上设置有用于开闭排液管的第一阀门；采样机构，其包括采样器以及驱动器，驱动器安装在检测箱上；检测机构，其设置在第一空腔内壁上且位于反应室上方，以检测待测品内抗生素浓度；以及控制机构，检测机构、驱动器以及第一阀门均电连接至控制机构。检测水产养殖过程中污水排放内抗生素药类含量的系统解决现有技术中因反应小室内待测样品不能及时更新而导致对实时待测样品的检测结果误差大的问题。