本发明提供了一种广谱植物源杀菌剂及其制备方法和应用，其中，本发明提供的广谱植物源杀菌剂，包括：蛇婆子茎的提取物。蛇婆子茎提取物，尤其是二氯甲烷粗提物和分离纯化得到的化合物antidesmone和waltherione C具有高效、低毒、低残留、无公害、成本低、杀菌活性强、抗菌谱广、分离过程简单等优势，其杀菌活性和广谱性要远高于商品化植物源杀菌剂蛇床子素、香芹酚和丁香酚，并且不与其它杀菌剂产生交互抗性，并对多菌灵高抗油菜菌核具有特效，与多菌灵存在一定的负交互抗性的关系，可作为农田植物真菌性病害潜在的杀菌剂。