本发明属于微生物检测领域，具体公开了一种多色荧光磁性化学鼻传感器快速检测病原微生物，并对作用于微生物的抗生素进行筛选，该“化学鼻”传感器包括多色荧光蛋白和季铵盐化的磁性纳米颗粒。基于上述“化学鼻”传感器，多色荧光蛋白信号猝灭，而后与待测病原微生物竞争结合，多色荧光蛋白游离发出荧光信号，再根据荧光信号的变化差异，得到不同微生物的响应信号；进一步地，“化学鼻”传感器与经抗生素作用的待测微生物竞争结合，对抗生素进行筛选。本发明的“化学鼻”传感器操作简单、使用方便，灵敏度高、稳定性强，可用于病原微生物及其作用抗生素的快速检测和筛选，能够为微生物感染、抗生素鉴别以及疾病诊断等方面提供参考和借鉴。