本发明公开了一种萝卜细胞质雄性不育基因分子标记引物，该引物可以特异识别萝卜细胞质雄性不育基因orf138，用于分子辅助选择育种，进行萝卜细胞质雄性不育基因orf138的基因分型。利用上述分子标记引物扩增待测萝卜总DNA，对所得的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳检测，当出现212bp大小的电泳条带时，判定待测萝卜中含有细胞质雄性不育基因orf138，表明其雄性不育表型由orf138基因导致。若未出现电泳条带，判定待测萝卜中不含细胞质雄性基因orf138。利用该分子标记引物，可快速鉴定萝卜细胞质雄性不育类型，且准确率高，特异性强，方便快捷。