本发明提供PcFPS基因的引物对及利用该引物对扩增的基因在提高广藿香中百秋李醇含量的应用，涉及基因工程技术领域，所述PcFPS基因的引物对上下游引物的核苷酸序列分别如SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示。本发明提供的引物对能特异性扩增到百秋里醇合成相关的FPS基因，与其他引物相比该引物对特异性较高，不易扩增出非特异性条带。本发明还提供了PcFPS基因及其引物对在提高广藿香中百秋李醇含量的应用，利用PcFPS基因的引物对能够特异性扩增得到PcFPS基因，将该PcFPS基因转入广藿香中构建转基因广藿香，PcFPS基因过表达可有效提高百秋李醇的合成，提高转基因广藿香中的百秋李醇含量。