本发明涉及的是木霉菌混菌协同固体发酵制备的复合孢子粉及其应用，其中的木霉菌混菌协同固体发酵制备的复合孢子粉通过以下方法制备而成：一、菌株活化和孢子悬浮液制备；二、固体种子制备：分别制备绿色木霉菌固体种子、哈茨木霉固体种子和棘孢木霉固体种子，然后按质量比1 : 1 : 1的比例混合绿色木霉菌固体种子发酵物、哈茨木霉固体种子发酵物和棘孢木霉固体种子发酵物，最终得到混合菌种子；三、混合菌种子固体圆盘发酵；四、复合孢子粉获得。本发明采用混合菌种子固体发酵工艺，获得三种木霉菌复合孢子粉，可以有效抑制土壤有害菌、改良重茬地和盐碱地和促进植物生长，减少化肥农药的使用。