本发明公开了一种农村生活污水深度脱氮方法。该方法所用装置包括厌氧区、低氧区、缺氧区和沉淀区；农村生活污水和来自于沉淀区的回流污泥进入厌氧区，将污水中溶解性有机物转化为细菌体内贮存的PHAs；而后泥水混合液进入低氧区发生短程硝化厌氧氨氧化作用，氨氧化菌(AOB)将污水中部分氨氮氧化为亚硝态氮后，再由厌氧氨氧化菌将亚硝态氮和剩余部分氨氮转化为氮气和硝态氮；而后泥水混合液与沉淀区回流污泥进入缺氧区发生内源反硝化厌氧氨氧化作用，以活性污泥中内碳源作为反硝化碳源，反硝化菌和厌氧氨氧化菌将污水中的硝态氮和剩余全部氨氮转化为氮气，从而实现深度脱氮；最后泥水混合液最后进入沉淀区实现泥水分离，上清液作为处理后水排放。