本发明属于信号通路控制技术领域，公开了一种基因转录的信号通路控制方法，基于小鼠胚胎干细胞的实验改进机制模型，并分析途径‑途径串扰强度(CTS)对mRNA表达稳定性的影响。本发明根据调节方式调整这种稳定性。此外，有一个最佳的CTS，使表达模式最稳定，但自由能耗最高；CTS可以诱导mRNA水平的随机聚焦，但这是以能量为代价的；在这两种情况下，都存在串扰介导的权衡，这意味着纠缠信号通路可以控制表达稳定性和能量耗散；增强型的串扰信号通路可以在没有额外条件的情况下诱导SF，但需要更多的能量消耗；NESS的潜在景观具有交叉信号传导途径的系统对于理解细胞内过程具有良好的前景。