本发明公开了一种利用玄武岩恢复珊瑚礁生态系统的方法。选择符合珊瑚再生所需条件的珊瑚礁退化区域，将玄武岩块投放到该区域并至少覆盖待恢复区域的底质，放置的玄武岩块之间存在缝隙，珊瑚礁生态系统恢复。本方法采用的是利用玄武岩的特性促进该区域珊瑚幼体附着的自然修复方法，不会对其他区域珊瑚礁造成损伤，投放玄武岩可以对破碎的礁盘进行覆盖，稳固底质，还能减少修复过程中对环境造成破坏，有可能会促进珊瑚幼虫附着和吸引珊瑚礁生物的栖息。本发明利用火山岩恢复珊瑚礁生态系统的方法需要成本低，制作方便，大量减少人力、财力的投入。