本发明公开了一种基于三维DWT-DCT感知哈希的体数据多水印方法，属于多媒体信号处理领域。本发明的步骤是：首先对医用体数据进行3DDWT-DCT变换，选取前4×4×4个系数，再进行3D-IDCT变换，然后在反变换系数中通过感知哈希提取一个具有鲁棒特性的感知哈希值，并将多水印序列与该感知哈希值相关联得到一串二值密钥序列，然后将该二值密钥序列存于第三方；通过对待测体数据进行三维DWT-DCT感知哈希值的提取，并将提取的感知哈希值与存于第三方的二值序列相关联来进行多水印的提取。本发明是基于三维DWT-DCT感知哈希的体数据多数字水印技术，有较好的鲁棒性，多水印的嵌入不改变原始体数据的内容。