本发明公开了一种基于三维DWT-DFT感知哈希的体数据数字水印方法，属于多媒体信号处理领域。本发明的步骤是：首先对医用体数据进行3D-DWT、3D-DFT，选取前4×4×4个系数，再进行3D-IDFT变换，然后在反变换系数的实部中提取一个鲁棒的感知哈希值，并将该感知哈希值与嵌入的水印相关联得到一个二值密钥序列，并将该二值密钥序列存于第三方；再通过对待测体数据进行三维DWT-DFT体数据的感知哈希值的提取，并与存于第三方的二值序列相关联来进行水印的提取。本发明是基于三维DW-DFT感知哈希的体数据数字水印技术，有较好的鲁棒性，水印的嵌入不改变原始体数据的内容。