本发明公开一种红海榄钠离子逆向转运蛋白基因及其克隆与应用。本发明所提供的红海榄中Na+/H+逆向转运蛋白来源于红海榄Rhizophorastylosa，命名为RsNHX1。RsNHX1基因的全长cDNA序列为序列表中的SEQLDNo.1；RsNHX1基因的开放阅读框为序列表中的SEQLDNo.2；RsNHX1基因的蛋白质氨基酸序列为序列表中的SEQLDNo.3。该基因可用于构建的植物表达载体并转化植物，将会提高这些植物的耐盐性，使得这些植物可以在盐碱地上种植或者耐盐水浇灌，具有非常重要的经济效益和社会效益。