本发明公开了一种部分氧化海藻酸钠的方法，其步骤如下：1)配制海藻酸钠溶液；2)配制高锰酸钾溶液；3)用酸溶液调节海藻酸钠溶液的pH值；4)将高锰酸钾溶液加入到海藻酸钠溶液中，室温避光搅拌反应；待溶液无色时终止氧化反应；5)向反应后的溶液中加入氯化钠，然后加入乙醇使滤液析出沉淀，通过减压抽滤得到粗产物；6)将粗产物用水溶解后透析；7)透析完全后将透析液进行预冻，然后进行冷冻干燥，最终获得部分氧化海藻酸钠产物。本发明工艺简单易控，原材料易得，成本低，易于推广应用，制备得到的部分氧化后的海藻酸钠可用于可降解凝胶材料、药物缓释材料、生物载体材料和组织工程材料等。