本发明公开了一种卵形鲳鲹家系亲子鉴定的方法，针对采用多亲本制备混合家系的实例，筛选出11对遗传多样性高、扩增效率稳定的微卫星引物。结合毛细管电泳测序及软件分析，达到检测卵形鲳鲹家系个体亲子关系的目的。通过本发明的方法，卵形鲳鲹亲子鉴定准确率能够达到90%以上。