本发明公开一种用于改善胃肠道功能的药物组合物及其制备方法，该药物组合物含有的成分及其重量配比为：鼠李糖乳杆菌20份、约氏乳杆菌30份、双歧杆菌30份、干酪乳杆菌15份。本发明的药物组合物是一种以药食同源原料为组份的保健品胶囊，本发明的药物组合物预期可达到改善胃肠道功能的功效，以鼠李糖乳杆菌、约氏乳杆菌、双歧杆菌、干酪乳杆菌为主要原料，采用科学合理的生产工艺加工而成，本产品功能明确，质量可控，服用安全。本发明的药物组合物的制备方法简单，常规设备便可制备完成。