本实用新型提供了一种生物医药用发酵器皿，包括器皿底座、透明罩和器皿主体，透明罩位于器皿底座的上方位置，且器皿主体位于器皿底座的上方位置，器皿底座的上方嵌入有内置槽，且器皿底座的前端电性连接有电源接槽，器皿底座的顶部中间固定有加热板，且器皿底座的上方两侧固定有嵌合柱，加热板的下方电性连接有加热丝。该种生物医药用发酵器皿，设置嵌合柱与嵌合孔，嵌合柱与嵌合孔相互嵌合，且嵌合柱与嵌合孔半径均为零点五厘米，使用者将生物医药放入器皿底座上进行发酵，然后透明罩与器皿底座嵌合，通过嵌合柱与嵌合孔的相互嵌合使透明罩与器皿底座之间更加紧密，提高密封性，适用于领域的生产与使用，具有良好的发展前景。