本发明提供了一种医药瓶自动理瓶机，包括机架、料斗、传送带、传送电机、倾斜面板、卡盘、卡盘电机、护瓶板、以及翻瓶机构；料斗设于机架上，料斗用于装载瓶子；传送带和传送电机设于料斗的下方，传送带用于在传送电机驱动下将料斗内的瓶子输送到护瓶板内；倾斜面板设于料斗的下方并且位于传送带的延伸方向；卡盘和护瓶板均设于倾斜面板上，护瓶板设于卡盘的外围；翻瓶机构包括支架、筛选电机、以及筛选拨条；支架设于倾斜面板上并且位于料斗的下方；筛选电机通过支架安装在倾斜面板上；筛选拨条连接在筛选电机上；料斗的侧壁和倾斜面板平行，筛选拨条位于料斗的侧壁和倾斜面板之间。