本发明公开了城镇生态环境自愈系统，包括生活垃圾磁化热裂解模块、一体化污水处理模块、工厂化微藻产业模块、土壤修复剂制作模块和微藻浓缩模块；生活垃圾磁化热裂解模块通过热解炉将垃圾进行24小时热解处理，减量为1/200‑300灰烬排出，后续与藻水混和，用于土壤修复，烟气通过水换热设备，降温至45度，进入烟气处理设备，处理后，进入工厂化微藻产业模块利用，热解产生热量通过水换热系统。本发明具有快速、无害、无剩余、适应性强、占地面积小、资源化、生产微藻浓缩市场前景好、设备先进、能源循环利用、经济效益好等优点，解决了从源头上开展生活垃圾的分捡、回收、利用工程，生活垃圾运营处理费用高的问题。