本发明公开了一种中医药磨粉分离设备，包括底座、筛框和研磨箱体，所述研磨箱体的底部内壁通过螺钉固定有研磨槽，所述研磨箱体的底部外壁靠近两侧处焊接有两个支撑杆，且两个支撑杆的底部外壁均通过螺钉固定在底座的上表面，所述底座的顶部外壁靠近研磨箱体的一侧处通过螺钉固定有电机座，且电机座的顶部外壁通过螺钉固定有驱动电机，所述驱动电机的输出轴顶端焊接有转轴，且转轴的外壁上焊接有研磨盘，所述底座的顶部外壁靠近中间处通过螺钉固定有收集槽。本发明通过第一筛网能够将未研磨充分的药物隔挡下来进行二次研磨，避免研磨不充分的药物与研磨充分的药物混合影响后续生产工作的进行。