本发明提供了一种脱氢弯孢霉素在抑制Hedgehog通路中的应用，属于医药技术领域。本发明所述脱氢弯孢霉素结构式如式I所示，在0.125μM以上浓度不仅能浓度依赖性地显著抑制Hh蛋白诱导的Hedgehog通路激活，还能显著抑制SMO激动剂SAG诱导的Hedgehog通路激活，且两方面作用强度无明显差异，证明与现有上市的Hedgehog通路抑制剂作用靶蛋白不同。因此，治疗范围更广，并具有克服上市药物耐药的潜能，有显著的优越性。