本发明属于中医药技术领域，具体涉及一种抑制痤疮丙酸杆菌的中药组合物及其制备方法。主要是从黄芩、丹参、厚朴、陈皮、穿心莲和枇杷叶中提取黄芩苷、丹参素、厚朴酚、橙皮苷、穿心莲内酯、熊果酸活性成分，进行中药组合物的制备，将制备的中药组合物进行痤疮丙酸杆菌的抑菌实验，具有较好的抑菌效果。本发明所述中药组合物的原料天然温和、无刺激性、无副作用，不含色素、有机溶剂及其它功能性添加剂，患有痤疮者可以作为治疗痤疮的中药长期使用。同时本发明所述的中药活性成分提取工艺简单，产品得率高，适合大规模的工业化生产。