本实用新型公开了一种医药用微生物培养装置，包括壳体，所述壳体为中空设置，所述壳体中设有横向设置的隔板，且隔板将壳体内部分隔成加热腔和保温腔，所述加热腔位于保温腔上方设置，所述加热腔中设有加热装置，所述隔板中设有竖直设置的透气孔，且加热腔和保温腔通过透气孔连通，所述壳体的一侧侧壁设有与保温腔连通的进料口，且进料口的开口处转动连接有盖板，所述盖板的侧壁设有把手，所述保温腔中竖直排列设有多个固定板。本实用新型操作简单，使用方便，装置在意外发生碰撞时，限位块和限位槽的配合以及卡杆和卡槽的配合，使培养微生物的培养板牢牢固定在固定板上，使之不会倾倒，保证了微生物的安全，提高了装置的安全性能。