本发明属于医药技术领域，公开了一种用动态轴向压缩柱从金银花中分离纯化新绿原酸、绿原酸、隐绿原酸、断氧化马钱子苷四种单体的方法，其包括流动相配制、溶解过滤、动态轴向压缩柱填装、系统平衡、洗脱分离、浓缩等步骤。本发明在一次分离纯化过程中，可以同时制备四种单体，包括新绿原酸、绿原酸、隐绿原酸、断氧马钱子苷，通过高效液相色谱法检测，其纯度均在90%以上。本发明的方法操作简单，生产周期短，制备效率高，产品质量可控，且所用有机试剂均可以回收再用，是一种高效、环保、适用性强的工业制备金银花单体的分离纯化方法。