本发明公开了一种杯吡啶在中性生理pH值水溶液中对酸性氨基酸选择性识别的方法，其步骤是将杯吡啶和芘四磺酸四钠盐溶解于水中后混合均匀得到溶液，而后对该溶液在室温下进行荧光测试；然后将20种天然氨基酸分别加入到上述溶液中，一分钟后对所得溶液再分别在室温下进行荧光测试；最后将导致荧光信号发生变化的氨基酸及其与杯吡啶的混合物溶解于氘水中，对所得溶液在室温下分别进行核磁共振氢谱测试。本发明利用杯吡啶对酸性氨基酸的选择性识别实现了对生物活性物质酸性氨基酸缩合成的肽和酸性氨基酸代谢产物荧光传感检测的应用。因而，杯吡啶在中性生理pH值水溶液中对酸性氨基酸的选择性识别在生物医药领域有着广泛的潜在应用价值。