本发明公开了一种药物控释磷酸钙骨水泥复合微球、其制备方法及应用。本发明中通过采用丝素蛋白和羧甲基壳聚糖复配，以磷酸钙骨水泥固相粉末作为原料，并结合液滴冷凝法，制备得到磷酸钙骨水泥复合微球，制备方法简单，无需高温烧结，所述磷酸钙骨水泥复合微球具有较高的力学强度，良好的抗崩解性、降解性和细胞相容性。同时，本发明的介孔硅酸钙具有大量介孔，能够吸附药物，将其作为药物载体添加到磷酸钙骨水泥微球中，具有药物缓释效果，使得磷酸钙骨水泥微球具有骨重建和药物治疗的效果。