本发明提供一种治疗口腔溃疡的中药组合物，所述组合物以砂仁和龟板为君药，砂仁辛温，能散寒邪，温肾纳气，直接助养肾中阳气；龟板咸甘，性平，善滋阴潜阳，且为血肉有情之物，见效确切，正中病机；两药合用，滋阴补阳，于阴中求阳，阳得阴助而生化无穷，于阳中求阴，阴得阳升而源泉不竭；以附子、肉桂和石斛为臣药，所谓气有余便是火，附子、肉桂助砂仁引火归元，石斛甘寒，入肺胃肾经，能助龟板清热养阴，亦可顾护胃阴，防肉桂、附子伤胃；以黄连、升麻为佐，升麻性升散，黄连性苦寒，两药合用可直达病所，清热镇痛；诸药配伍，共奏清热解毒、滋阴降火，滋阴补阳的功效；本发明提供的治疗口腔溃疡的中药组合物治疗效果显著，明显降低复发率。