本发明公开了一种冻干机的箱体，包括箱体内壳，所述箱体内壳围成冻干仓，且所述箱体内壳上设置有与所述冻干仓相通的纯蒸汽输入管，还包括设置在所述箱体内壳外侧并与所述箱体内壳接触的辅助升温流路和辅助降温流路，所述辅助升温流路和所述辅助降温流路为相互独立的两套流路。本发明中所公开的冻干机的箱体，在灭菌时可以快速升温到灭菌温度，从而一方面降低饱和纯蒸汽的用量，降低生产成本，另一方面有效缩短升温时间，提高灭菌效率；完成灭菌后，又可以快速降温至合适温度，大大缩短了冻干机闲置等待的时间，提高了生产效率以及设备利用率。本发明还公开了一种采用上述箱体的冻干机。