本发明涉及一种转SmMYB2基因同时提高丹参中丹酚酸及花青素含量的方法。本发明从药用植物丹参中克隆得到一条SmMYB2转录因子，通过构建植物过表达及抑制表达载体，遗传转化丹参叶片外植体，获得转基因毛状根；利用QRT‑PCR分析转基因株系中丹酚酸、丹参酮及花青素合成途径中关键酶基因的表达；运用高效液相色谱法分析转基因株系中丹酚酸及丹参酮的含量；利用分光光度计测定转基因植株中花青素的含量。与现有技术相比，本发明解析了SmMYB2调控丹酚酸及花青素生物合成的机制，提供了一种提高丹参中丹酚酸及花青素含量的方法，为生产具有重要临床需求的丹酚酸提供了一种新型优质原料，也为提高花青素等其他物质提供了一种新的思路。